Produiten

Mir hu viru kuerzem gemellt datt Pyrennukleotid preferentiell vis-à-vis vun engem abasesche Site, den 3'-T vun engem Thymin-Dimer, an déi meescht onbeschiedegt Basen duerch Hef DNA Polymerase eta (pol eta) agefouert gëtt.Well Pyren eng netpolar Molekül ass ouni H-Bindungsfäegkeet, ginn déi ongewéinlech héich Effizienz vun der dPMP-Insertioun u seng superior Basisstackfäegkeet zougeschriwwen, a ënnersträicht d'Wichtegkeet vum Base-Stacking an der Auswiel vun Nukleotiden duerch Pol eta.Fir d'Roll vun der H-Bindung an der Basispaargeometrie bei der Selektioun vun Nukleotiden duerch Pol eta z'ënnersichen, hu mir d'Insertiounseffizienz vun de Basismodifizéierten Nukleotiden 2,6-Diaminopurin, 2-Aminopurin, 6-Chloropurin an Inosin festgeluecht, déi géifen eng aner Zuel vun H-Bindungen mat der Schablounbasis maachen ofhängeg vun der Basispaargeometrie.Watson-Crick Base Pairing schéngt eng wichteg Roll bei der Auswiel vun Nukleotidanalogen fir d'Insertioun vis-à-vis C an T ze spillen, wéi beweist duerch d'Ofsenkung vun de relativen Insertiounseffizienz mat enger Ofsenkung vun der Unzuel vun de Watson-Crick H-Bindungen an enger Erhéijung vun d'Zuel vun den Donor-Spender an Akzeptor-Acceptor Interaktiounen.D'Selektivitéit vun der Nukleotid-Insertioun ass méi grouss vis-à-vis vum 5'-T wéi den 3'-T vum Thymin-Dimer, am Aklang mat fréiere Wierker, déi suggeréieren datt de 5'-T méi steif gehale gëtt wéi den 3'-T.Ausserdeem schéngt d'Insertioun vun A vis-à-vis vun den Ts vum Dimer duerch Watson-Crick Base Pairing vermëttelt ze ginn an net duerch Hoogsteen Base Pairing baséiert op der bal identescher Insertion Effizienz vun A a 7-deaza-A, déi lescht fehlt H- Bindungsfäegkeet op N7.Déi relativ Effizienz fir d'Insertioun vun Nukleotiden, déi Watson-Crick Basepaar kënne bilden, parallel zu deene fir de Klenow Fragment, wärend de Klenow Fragment méi staark géint Mëssmatch diskriminéiert, am Aklang mat senger méi grousser Form Selektivitéit.Dës Resultater ënnersträichen d'Wichtegkeet vun H-Bindung a Watson-Crick Basepaar Geometrie bei der Selektioun vun Nukleotiden vu béide Pol eta an dem Klen ow Fragment, an déi manner Roll vun der Formauswiel bei der Insertioun vu Pol eta wéinst senger méi oppener a mannerer. limitéiert aktiv Site.